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16s测序 生态
微生物功能预测的作用
答:
微生物功能预测的作用如下:把物种的“身份”和它们的“功能”对应起来。根据菌群代谢功能预测结果,我们一方面能一窥菌群功能谱的概貌,发挥菌群多样性组成谱
测序
性价比高的优势;另一方面也能帮助指导后续宏基因组De novo鸟枪法测序的实验设计,更合理地筛选用于后续研究的样本。通过将现有的
16S
rRNA基因...
通过保守序列
测序
来鉴定微生物,可靠性有多少
答:
二代
测序
在微生物研究中使用的频率越来越高了,通过
16S
rDNA测序可以得到微生物基因组的序列信息,通过序列比对即可鉴定出微生物的种属,从而进行后续的分析。今天我们就来聊一聊16S rDNA测序是如何鉴定微生物到种的!1.什么是 16S rDNA?细菌rRNA(核糖体RNA)按沉降系数分为3种,分别为5S、16S和23S ...
细菌
16S
rDNA通用引物有哪些?
答:
常用一对引物:27F和1492R
鸡毛松的科学研究
答:
同时由于菌株J4和M8在侵染刺槐结瘤试验中,J4表现出较高固氮酶活性,M8的结瘤的形状为圆锥状和圆形的组合体,与其他的结瘤形状不同,因此对J4和M8也进行了
16S
rDNA的
测序
鉴定。通过16S rDNA的测序鉴定,证明J4和M8为芽孢杆菌。 由于明确了M8和J4是芽孢杆菌,并能导刺槐致结瘤,为了研究芽孢杆菌M8和...
16S
rDNA的介绍
答:
其进化具有良好的时钟性质,在结构与功能上具有高度的保守性,素有“细菌化石”之称。在大多数原核生物中rDNA都具有多个拷贝,5S、
16S
、23S rDNA的拷贝数相同。16S rDNA由于大小适中,约1.5Kb左右,既能体现不同菌属之间的差异,又能利用
测序
技术较容易地得到其序列,故被细菌学家和分类学家接受。
常规PCR,目的是为了测
16S
,需要用荧光标记的引物来做PCR吗?
答:
16S
PCR 以查到很多通用引物的序列,直接按照这些序列设计引物即可扩增获得16S的序列。然后可以选择把PCR产物克隆到克隆载体上,选择1-3个克隆去
测序
,这样直接用克隆载体上的引物就可以进行测序。如果不想克隆,可以用扩增引物测序,但是没法拿到全长的序列,因为特别靠近引物的部分测得不是很准。另外,...
常规PCR,目的是为了测
16S
,需要用荧光标记的引物来做PCR吗?
答:
16S
PCR 以查到很多通用引物的序列,直接按照这些序列设计引物即可扩增获得16S的序列。然后可以选择把PCR产物克隆到克隆载体上,选择1-3个克隆去
测序
,这样直接用克隆载体上的引物就可以进行测序。如果不想克隆,可以用扩增引物测序,但是没法拿到全长的序列,因为特别靠近引物的部分测得不是很准。另外,...
的技术,能不能对细菌这样的微生物进行基因
测序
答:
能不能对细菌这样的微生物进行基因
测序
基因组DNA测序文库构建 1. 对收到的DNA样品进行检测,取2-3ul样品,用1%的琼脂糖胶检测,对于纯度不够(含RNA或蛋白)的DNA样品需要柱纯化后重新检测。对于细菌基因组需要扩增
16S
全长序列,进行验证。对于噬菌体或者质粒样品,若用16S全长引物扩增,无目的条带则...
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